W latach 1952-1957 Jan Paweł II był kaznodzieją i spowiednikiem w tej Bazylice. Jako Papież nawiedził ją trzykrotnie, a w 1991 r. przy ołtarzu stojącym u jej wejścia odprawił mszę świętą, podczas której dokonał beatyfikacji bł. Anieli Salawy. 17 maja 1981 r. przed Bazyliką Mariacką zebrali się wszyscy uczestnicy Białego Marszu, zorganizowanego po zamachu na życie Jana Pawła II. W ścianę kościoła (od strony Rynku Głównego) wmurowane są tablice upamiętniające beatyfikację AnAieli Salawy oraz Biały Marsz).